搭建进程
2026.7.6
桑树小站上线
第一批板块开放使用：留言板、论文、桑树基因组、桑树基因资源
研究动态
及时发布桑树基因组学、功能基因组学、分子育种等领域的最新研究进展和平台更新公告。
桑树基因组和功能基因
整理桑树基因组学、功能基因组学、分子生物学等相关研究论文，持续更新。
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论文总数
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时间范围
| # | 年份 | 论文标题 | 期刊 | 2025分区 | 来源 | 国家 | DOI |
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基因组
桑树基因组数据库收录已发表的桑树基因组数据，提供基因组结构、基因模型、功能注释等信息浏览和检索服务。
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物种数
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基因组版本
参考基因组
| # | 年份 | 物种名称 | 品种 | 性别 | 组装水平 | 基因组大小 | 基因数 | 染色体 | BUSCO | 测序平台 | 数据库 | 论文标题 | 链接 |
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桑树基因资源
收录桑树功能基因研究数据，包括基因名称、所属家族、功能描述、验证状态等信息。
701
基因总数
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基因家族
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已验证
| 基因名 | 全称 | 家族 | 年份 | 期刊 | 功能描述 | 验证 |
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基因组浏览
浏览桑树基因组数据，包括不同品种的基因组组装、基因模型、功能注释等信息。
🌿 基因组版本
查看各版本基因组的详细信息、组装质量和染色体数目
🧪 基因模型
浏览基因结构、编码蛋白、功能域等信息
🏷️ 功能注释
查看基因的GO、KEGG、PFAM等注释结果
🔗 共线性
查看基因组间的共线性关系和结构变异
🧬 数据持续录入中，即将开放浏览功能
品种资源
收集整理不同桑树品种的形态特征、分布区域、基因组数据等信息。
| 品种名称 | 学名 | 分布区域 | 数据类型 | 来源 |
|---|---|---|---|---|
| 数据持续录入中... | ||||
基因搜索
输入基因名、Gene ID、关键词，检索桑树基因组中的目标基因及其功能注释、表达信息。
🔍
输入关键词开始搜索桑树基因
在线分析
提供桑树基因组数据分析工具，包括序列比对、进化树构建、表达分析等。
🔄 序列比对
输入核酸或蛋白序列，与桑树基因组进行BLAST比对
🌳 进化树构建
选择基因家族序列，构建系统进化树
📈 表达分析
分析基因在不同组织、发育阶段或处理条件下的表达模式
🎯 功能富集
对目标基因集进行GO和KEGG功能富集分析
🔍 共表达网络
构建基因共表达网络，挖掘核心调控基因
🧬 基因家族
分析特定基因家族的结构、功能和进化
🛠️ 分析工具开发中，敬请期待
资源下载
下载桑树小站相关软件工具和资源文件。
DayDayUp
一款简洁高效的桌面日历工具，支持日程计划、执行和复盘等功能。
研究资源
分享桑树研究相关的实验方案、引物序列、操作规程等资源。
🧪 实验方案
DNA/RNA提取、基因克隆、表达分析等标准操作流程
🎬 引物设计
常用基因的PCR引物、qPCR引物序列
📖 操作规程
仪器操作、数据分析软件使用指南
📁 工具脚本
生物信息分析脚本和 pipelines
📂 资源整理中，即将开放共享
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留言板
后台管理
关于数据库
桑树小站 旨在建设桑树基础研究与产业应用的综合数据平台。
本数据库提供桑树基因组数据的浏览、搜索、分析和下载服务，支持桑树功能基因组学、分子育种等研究工作。
平台数据来源于已发表的桑树基因组研究及本实验室的持续更新。我们致力于为桑树科研工作者提供高质量的数据资源和技术支持。
如何使用
请参考 桑树小站用户指南 获取详细使用说明。
🔍 搜索基因
在 Search 页面输入基因名或关键词查询
🧬 浏览基因组
在 Browse 页面查看基因组结构和基因信息
📊 在线分析
在 Analysis 页面使用各种分析工具
⬇️ 下载数据
在 Download 页面获取所需数据文件
如何引用
桑树小站（MRAD）.
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